参照国家卫生健康委和广东省卫生健康委工作职能，市卫生健康局的主要职能是：
(一)拟定卫生健康以及促进中医药事业发展的政策、规划，制定并实施有关标准和技术规范。
(二)协调推进深化医药卫生体制改革，研究提出深化医药卫生体制改革重大方针、政策、措施的建议。
 (三)制定并组织落实重大疾病防治规划以及严重危害人民健康公共卫生问题的干预措施，负责卫生应急工作，组织指导突发公共卫生事件的预防控制和各类突发公共事件的医疗卫生救援。
(四)组织拟订并协调落实应对人口老龄化政策措施，负责推进老年健康服务体系建设和医养结合工作。
(五)组织制定药物政策，落实国家基本药物制度，开展药品使用监测。
(六)负责职责范围内的职业卫生、环境卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生等公共卫生的监督管理，负责传染病防治监督，健全卫生健康综合监督体系。组织开展爱国卫生运动。
(七)负责医疗机构、医疗服务行业管理办法的监督实施，建立医疗服务评价和监督管理体系。
 (八)负责计划生育管理和服务工作，开展人口监测预警，研究提出人口与家庭发展相关政策建议。
(九)指导镇街（园区）卫生健康工作，指导基层医疗卫生、妇幼健康服务体系和全科医生队伍建设。
(十)贯彻执行中医药事业发展的方针政策，推动中医药强市建设。