东莞市烟草专卖局隶属广东省烟草专卖局和东莞市人民政府双重领导，依照《烟草专卖法》及其实施条例，实施烟草专卖行政执法职能。
主要职能有：（一）监督、检查《中华人民共和国烟草专卖法》、《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》（国务院令第223号）及国家局有关政策规定在我市的执行情况；（二）依法办理烟草专卖零售许可证，做好证件管理工作；（三）打击制售假、走私贩私烟草制品的不法行为，为合法的生产经营提供保障和服务；（四）依法宣传烟草专卖法律法规，开展市场监督管理，切实维护卷烟市场秩序，保护消费者、卷烟经营户的合法权益。